Впервые в с. Яренске Ленского района музей был открыт как Музей наглядных пособий в 1905 году на основании Постановления уездного земского собрания от 6 октября 1904 г., где было указано: «на устройство при Уездном училищном совете музея учебных пособий внести в смету 1905 года 50 рублей». В 1905 году музей был организован при Яренском мужском приходском училище.
В 1919 году переименован в районный музей местного края. В 1920-х и начале 30-х музей работал на общественных началах и находился в ведении общества краеведения. В 1929 году музею передается здание Спасо-Преображенского собора, где он располагается и в настоящее время. В 1934 году райисполком ввел штатную единицу заведующего музеем.
К 1984 г. завершаются работы по реставрации иконостаса собора, в 1989 г. начата работа по консервации настенной живописи.
Памятники истории и культуры, составляющие фонды музея, отражают материальную и духовную жизнь прошлых поколений, многовековую историю Вычегодского края. В них воплощены выдающиеся события в жизни района, трудовые и боевые подвиги земляков.
В 2013 году при музее открыто обособленное подразделение «Центр народной культуры и туризма», в котором работает Резиденция Матушки Зимы.